Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka1P18653 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka1P18653 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms