Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gata1P17679 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata1P17679 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gata1P17679 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gata1P17679 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata1P17679 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gata1P17679 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gata1P17679 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gata1P17679 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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