Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Defa-rs1P17533 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs1P17533 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms