Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PrkceP16054 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkceP16054 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PrkceP16054 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PrkceP16054 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkceP16054 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PrkceP16054 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PrkceP16054 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PrkceP16054 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms