Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ca3P16015 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ca3P16015 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ca3P16015 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ca3P16015 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ca3P16015 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ca3P16015 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ca3P16015 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ca3P16015 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ca3P16015 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ca3P16015 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ca3P16015 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ca3P16015 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ca3P16015 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms