Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp53P15975 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp53P15975 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp53P15975 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp53P15975 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp53P15975 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp53P15975 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp53P15975 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms