Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd44P15379 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd44P15379 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd44P15379 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms