Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrphP15331 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrphP15331 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrphP15331 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrphP15331 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrphP15331 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrphP15331 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrphP15331 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrphP15331 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrphP15331 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PrphP15331 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrphP15331 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrphP15331 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrphP15331 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrphP15331 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrphP15331 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrphP15331 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrphP15331 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrphP15331 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrphP15331 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrphP15331 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrphP15331 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrphP15331 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrphP15331 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrphP15331 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms