Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Dnmt1P13864 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Dnmt1P13864 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Dnmt1P13864 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Dnmt1P13864 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Dnmt1P13864 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Dnmt1P13864 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Dnmt1P13864 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms