Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Vpreb2P13373 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vpreb2P13373 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms