Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nr4a1P12813 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr4a1P12813 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr4a1P12813 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms