Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ApcsP12246 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ApcsP12246 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms