Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itga5P11688 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga5P11688 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itga5P11688 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms