Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DmdP11531 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DmdP11531 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DmdP11531 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DmdP11531 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DmdP11531 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
DmdP11531 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DmdP11531 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
DmdP11531 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
DmdP11531 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmdP11531 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmdP11531 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
DmdP11531 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmdP11531 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmdP11531 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmdP11531 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
DmdP11531 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
DmdP11531 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
DmdP11531 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmdP11531 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmdP11531 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
DmdP11531 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmdP11531 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
DmdP11531 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DmdP11531 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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