Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsbP10605 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CtsbP10605 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CtsbP10605 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtsbP10605 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms