Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP10400 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP10400 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP10400 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PolP10400 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP10400 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PolP10400 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PolP10400 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PolP10400 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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