Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl1P10146 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl1P10146 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms