Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Myod1P10085 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Myod1P10085 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Myod1P10085 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms