Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Amd1P0DMN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Amd1P0DMN7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Amd1P0DMN7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms