Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Becn2P0DM65 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Becn2P0DM65 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Becn2P0DM65 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms