Protein–RNA interactions for Protein: P0C0A3

Chmp6, Charged multivesicular body protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp6P0C0A3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chmp6P0C0A3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp6P0C0A3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms