Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxa1P09022 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa1P09022 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hoxa1P09022 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms