Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefmP08553 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefmP08553 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefmP08553 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NefmP08553 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
NefmP08553 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NefmP08553 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
NefmP08553 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
NefmP08553 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NefmP08553 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NefmP08553 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NefmP08553 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
NefmP08553 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NefmP08553 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NefmP08553 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NefmP08553 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NefmP08553 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NefmP08553 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NefmP08553 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NefmP08553 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NefmP08553 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NefmP08553 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NefmP08553 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NefmP08553 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NefmP08553 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefmP08553 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefmP08553 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefmP08553 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefmP08553 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NefmP08553 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NefmP08553 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NefmP08553 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NefmP08553 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NefmP08553 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NefmP08553 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NefmP08553 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NefmP08553 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NefmP08553 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NefmP08553 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NefmP08553 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms