Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SparcP07214 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SparcP07214 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SparcP07214 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SparcP07214 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SparcP07214 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SparcP07214 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SparcP07214 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SparcP07214 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SparcP07214 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SparcP07214 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SparcP07214 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SparcP07214 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SparcP07214 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SparcP07214 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SparcP07214 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SparcP07214 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms