Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P04940 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04940 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04940 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04940 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04940 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P04940 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P04940 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P04940 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P04940 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P04940 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P04940 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04940 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P04940 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P04940 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P04940 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms