Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a1P04919 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a1P04919 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a1P04919 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a1P04919 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc4a1P04919 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc4a1P04919 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms