Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
H2-AaP01910 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
H2-AaP01910 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms