Protein–RNA interactions for Protein: P01853

T-cell receptor gamma chain C region C10.5, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01853 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01853 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01853 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01853 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01853 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01853 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01853 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01853 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01853 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01853 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01853 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01853 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01853 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01853 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms