Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01789 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01789 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01789 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
P01789 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01789 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01789 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01789 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01789 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P01789 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01789 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01789 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01789 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01789 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01789 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01789 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms