Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01741 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01741 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01741 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01741 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01741 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01741 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01741 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01741 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01741 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01741 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms