Protein–RNA interactions for Protein: P01727

Ig lambda-1 chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01727 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01727 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01727 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01727 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01727 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01727 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01727 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01727 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01727 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01727 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01727 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01727 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01727 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms