Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01661 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01661 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01661 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01661 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01661 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01661 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01661 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01661 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01661 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01661 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01661 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01661 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01661 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01661 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01661 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01661 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01661 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01661 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01661 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01661 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01661 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01661 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms