Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mtatp6P00848 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Mtatp6P00848 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms