Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Robo1O89026 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Robo1O89026 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Robo1O89026 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Robo1O89026 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo1O89026 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Robo1O89026 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo1O89026 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms