Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Setdb1O88974 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Setdb1O88974 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Setdb1O88974 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Setdb1O88974 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms