Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Spsb2O88838 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Spsb2O88838 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms