Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tom1O88746 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tom1O88746 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tom1O88746 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tom1O88746 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tom1O88746 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms