Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pak1O88643 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pak1O88643 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pak1O88643 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms