Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cops6O88545 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops6O88545 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cops6O88545 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cops6O88545 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms