Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cops3O88543 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cops3O88543 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms