Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Stra6O70491 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stra6O70491 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stra6O70491 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms