Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Foxq1O70220 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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