Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alx3O70137 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alx3O70137 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alx3O70137 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms