Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FiglaO55208 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FiglaO55208 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FiglaO55208 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FiglaO55208 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FiglaO55208 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms