Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Copb2O55029 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Copb2O55029 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Copb2O55029 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms