Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bnip3O55003 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bnip3O55003 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Bnip3O55003 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Bnip3O55003 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms