Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TsksO54887 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TsksO54887 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TsksO54887 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TsksO54887 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TsksO54887 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TsksO54887 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TsksO54887 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TsksO54887 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TsksO54887 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TsksO54887 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TsksO54887 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TsksO54887 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TsksO54887 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TsksO54887 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TsksO54887 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TsksO54887 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TsksO54887 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TsksO54887 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TsksO54887 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TsksO54887 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TsksO54887 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TsksO54887 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TsksO54887 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TsksO54887 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TsksO54887 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TsksO54887 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TsksO54887 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TsksO54887 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TsksO54887 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TsksO54887 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TsksO54887 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TsksO54887 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms