Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CrxO54751 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CrxO54751 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CrxO54751 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CrxO54751 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CrxO54751 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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