Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EdaO54693 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EdaO54693 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EdaO54693 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
EdaO54693 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
EdaO54693 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
EdaO54693 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
EdaO54693 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
EdaO54693 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EdaO54693 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
EdaO54693 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EdaO54693 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EdaO54693 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
EdaO54693 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EdaO54693 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EdaO54693 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
EdaO54693 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
EdaO54693 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
EdaO54693 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
EdaO54693 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
EdaO54693 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms