Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stag2O35638 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stag2O35638 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag2O35638 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag2O35638 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag2O35638 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stag2O35638 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms